新疆青年科技獎設立于2002年，由自治區(qū)黨委組織部、自治區(qū)人力資源和社會保障廳、共青團新疆維吾爾自治區(qū)委員會、自治區(qū)科學技術協(xié)會共同組織實施，自治區(qū)科協(xié)具體承辦，評獎委員會辦公室設在自治區(qū)科協(xié)學會學術部（國際部）。重點獎勵為自治區(qū)經濟建設、社會發(fā)展和科技進步做出突出貢獻的40周歲以下（女性45周歲以下）的優(yōu)秀青年科技工作者。新疆青年科技獎每兩年評選一屆，每屆授獎不超過20名。截止目前已組織實施了十一屆評選，共評選218名新疆青年科技獎獲得者。